Мозг и спинной мозг рептилий имеют несколько передовых особенностей относительно амфибий, включая больший размер и большее определение структурных подразделений, и большее развитие коры головного мозга. Нервные связи между обонятельными луковицами, корпусом, и несколько других подкорковых структур присущи рептилиям, и эти связи были сохранены в последующем развитии таким образом, что они присутствуют в млекопитающих, включая людей. Этот набор связей иногда упоминается как «рептильный мозг» или «R-комплекс» и, как считают ученые, представляет собой нервный кругооборот, необходимый для основных функций, таких как хищничество и спаривание, а также связан с социальным поведением животных в пределах от сотрудничества с себе подобными до агрессии к другим животным.