Некоторые ученые считают, что рептилии впервые были развиты от амфибий приблизительно 250-270 миллионов лет назад в Каменноугольный период Палеозойской эры и, были доминирующими животными в фауне планеты в течение Мезозойской эры, иногда называемой Эрой рептилий. Динозавры, морской ихтиозавр и плезиозавр, и летящие птерозавры достигли пика своего развития, и распределения в более поздней части этой эры (последний Меловый период). Подобные млекопитающим рептилии считались самыми ранними представителями «рептильной» истории, и Триасовый период дал начало эволюции млекопитающих. Предки птиц являлись своего рода результатом эволюции предшественников динозавров; первые известные птицы жили в Юрский период. Единственные рептилии, которые выжили в кайнозойскую эру, принадлежали теперь живущим семьям. Приблизительно 6 000 живущих разновидностей рептилий представляют очень маленькую семью рептилий, которые когда-то представляли собой очень обширный класс животных.