У некоторых змей и ящериц, очень длинные промежутки времени могут проходить между последовательными приемами пищи, и рептилии способны к физиологической экономии энергии, регулируя свои пищеварительные механизмы. Этот процесс сохраняет энергию, потому что поддержание функциональной пищеварительной ткани при отсутствии пищи потребовало бы значительных затрат энергии. Рептилии сохраняют это отрегулированное состояние до тех пор, пока следующая еда не поступает в организм.
Газовый обмен происходит через легкие. У большинства змей есть только одно легкое (слева). У сердца рептилий есть три камеры, два атриума и один желудочек; кроме крокодиловых, у которых второй желудочек присутствует, производя четырехкамерное сердце, также как у млекопитающих. Даже у рептилий с трехкамерным сердцем, перегородка существует в пределах желудочка и минимизирует смешивание окисленной и неокисленной крови. Исследователи изучили физиологические механизмы, связанные с передвижением животного, и нашли интересные параллели между рептилиями и млекопитающими в скорости восстановления организмов от истощения.